Sammenslåingen vil resultere i et selskap som blant annet vil omfatte merkene Peugeot, Citroën, Fiat, Chrysler, Jeep, Alfa Romeo og Maserati.
EU-kommisjonen er bekymret for at fusjonen kan svekke konkurransen i markedet for lette varebiler, som veier mindre enn 3,5 tonn.
Vestager påpekte onsdag at det i utgangspunktet er færre produsenter av varebiler enn av personbiler.
Granskingen skal etter planen være fullført i oktober. Fiat Chrysler Automobiles (FCA) og PSA håper å ha gjennomført fusjonen i løpet av første kvartal neste år.
